故事一開(kāi)始張無(wú)忌被關(guān)在武當(dāng)山下的屋內(nèi)，調(diào)查屋子的門(mén)離開(kāi)小屋，然后從地圖右上的出口上武當(dāng)山，山道上會(huì)發(fā)生戰(zhàn)斗，張無(wú)忌被人擄走。武當(dāng)山上上演張翠山夫婦自刎劇情，張無(wú)忌在大殿內(nèi)因寒毒發(fā)作暈厥。
　　
 兩年后，無(wú)忌醒來(lái)先去紫霄殿內(nèi)殿找張三豐，對(duì)話后去找宋遠(yuǎn)橋、俞蓮舟、張松溪讓他們傳授武功，分別會(huì)獲得梯云縱秘籍、六和勁秘籍、武當(dāng)長(zhǎng)拳秘籍和小擒拿手秘籍。隨后張三豐會(huì)帶無(wú)忌上少林求取九陽(yáng)真經(jīng)，來(lái)到武當(dāng)山下城鎮(zhèn)，進(jìn)入河岸地形，然后經(jīng)過(guò)漢水渡口南，再進(jìn)入河岸地形，按A鍵改變同伴的AI類(lèi)型為死士型，這樣張三豐會(huì)解決所有敵人，你只要負(fù)責(zé)撿錢(qián)和煉藥材料就可以了，盡量多打點(diǎn)錢(qián)，這樣在少林寺山下城鎮(zhèn)就可以買(mǎi)件七色袍和鐵制手套，以后的戰(zhàn)斗會(huì)輕松很多，盡量就不要用修改了，游戲改了就沒(méi)有多大意義了。

 來(lái)到少林寺山腰，空聞斷然拒絕了張三豐的請(qǐng)求，無(wú)奈之下張三豐只得帶無(wú)忌返回武當(dāng)，途中經(jīng)過(guò)漢水時(shí)救下常遇春，常遇春為報(bào)答救命之恩決定帶無(wú)忌去蝴蝶谷找胡青牛醫(yī)治，而同時(shí)救下的周芷若則由張三豐帶回武當(dāng)。
　　
 來(lái)到蝴蝶谷之后，胡青牛拒絕為無(wú)忌醫(yī)治，常遇春也拒絕了胡青牛的醫(yī)治，無(wú)忌與小童對(duì)話知道需在毒花林和百草林能找到何首烏、紫河車(chē)、大黃制成紫雪寶丹才能救常遇春。如果之前買(mǎi)有裝備的話戰(zhàn)斗就會(huì)很容易了，打到需要的物品再回去醫(yī)治常遇春，救好常遇春之合他會(huì)離開(kāi)。
　　
 又過(guò)了兩年，無(wú)忌遇到了紀(jì)曉芙等人上門(mén)求醫(yī)。無(wú)忌先為她稍加診治，隨后再去請(qǐng)示胡青牛，胡青牛不治非明教底子，但是無(wú)忌會(huì)以巧妙的方法套出藥方，隨后在百草里和毒花林里找到藥材桃仙、大黃、五味子、五靈脂、熊膽、玉蜜蜂漿便可讓小童配藥。但是當(dāng)晚發(fā)現(xiàn)有人在藥里下毒，次日與紀(jì)曉芙商議后得知是金花婆婆害了這些門(mén)派的人，胡青牛得知此事趕去救王難姑，按照胡青牛的藥方救下王難姑就會(huì)發(fā)生胡青牛講述與王難姑前塵往事的劇情，之后金花婆婆來(lái)到，在無(wú)忌的幫助下，金花婆婆鎩羽而歸，無(wú)忌因此獲得了醫(yī)經(jīng)與毒經(jīng)。滅絕師太來(lái)到蝴蝶谷要紀(jì)曉芙去殺楊逍，紀(jì)曉芙寧死不從而遭滅絕殺害，她臨終前讓無(wú)忌帶著楊不悔去昆侖山坐忘峰找楊逍。

 這時(shí)畫(huà)面會(huì)轉(zhuǎn)到死亡村莊廢墟，先買(mǎi)一個(gè)人參和南星，走過(guò)橋的好邊，找到范峰、范子嫣，跟范子嫣說(shuō)話，對(duì)話選項(xiàng)時(shí)選擇愿意給他一條人參，這樣長(zhǎng)大之后在濠洲城會(huì)又遇到武器商人范峰，對(duì)話之后張無(wú)忌會(huì)得到無(wú)名護(hù)手，這樣最強(qiáng)的護(hù)手就到手了。
　　
 再走回去點(diǎn)詹春與蘇習(xí)之與他們對(duì)話，用南星就給他們解毒，之后會(huì)結(jié)伴上昆侖山，然后為何太沖的愛(ài)妾五姑治病，在房屋邊上打一條蛇得靈脂蘭，治好五姑之后何太沖設(shè)宴款待，但是宴席上的酒卻有毒，無(wú)忌保護(hù)楊不悔逃出了昆侖派，然后去昆侖山后山關(guān)琳琳、郭青，他們被人點(diǎn)了穴，選擇救他們后無(wú)忌根據(jù)胡青牛的醫(yī)術(shù)所記載來(lái)解穴，但是第一次他們只能說(shuō)話，仍然不能動(dòng)彈，再對(duì)話了解被點(diǎn)穴原因，選擇繼續(xù)解穴就能得到四象拳秘籍。走出昆侖派大殿再到昆侖山山腳下何太沖夫婦會(huì)來(lái)追殺，這時(shí)楊逍會(huì)出手相救，楊家父女團(tuán)聚，無(wú)忌離開(kāi)昆侖山。

 來(lái)到昆侖山山下城鎮(zhèn)之后換上牛皮鞋、狂擊手套和金織頭冠，找到小孩廖勝先，對(duì)話之后會(huì)新增尋找千年雪蓮、千年雪參的任務(wù)，無(wú)忌進(jìn)入下方的區(qū)域進(jìn)入亂石地形，無(wú)忌會(huì)發(fā)現(xiàn)自己迷路了，前進(jìn)到劇情時(shí)會(huì)打倒幾條狗救下小猴子，之后無(wú)忌會(huì)受傷昏倒，到醒來(lái)后發(fā)現(xiàn)身在朱武連環(huán)莊的仆奴丫鬟房間，去大殿見(jiàn)到衛(wèi)壁和武青嬰前來(lái)拜年，隨后無(wú)忌偷聽(tīng)朱九真等三人的談話，但卻因?yàn)樾Τ雎暥�被迫與衛(wèi)壁動(dòng)手，獲勝后朱長(zhǎng)齡前來(lái)維護(hù)無(wú)忌，次日假冒金毛獅王的人來(lái)朱武莊生事，無(wú)忌將其識(shí)破并說(shuō)出自己的真實(shí)身份，并約好與眾人一起準(zhǔn)備前往冰火島，某日晚朱九真將小張無(wú)忌點(diǎn)穴之后，到連環(huán)莊庭院跟小鳳說(shuō)話，小鳳會(huì)請(qǐng)小張無(wú)忌幫她捉十條蛇，話說(shuō)完之后直接傳送到森林地形，打死十條蛇之后，會(huì)回到庭院，跟小鳳說(shuō)完話之后會(huì)得到鐵制手套，之后跟蹤朱九真發(fā)現(xiàn)了他們欲借無(wú)忌之手奪取屠龍刀的陰謀，無(wú)忌被迫在大殿與朱長(zhǎng)齡決戰(zhàn)，在逃離朱武莊時(shí)與朱長(zhǎng)齡一起跌落懸崖。
醒來(lái)后無(wú)忌身在驚神峰山谷，打倒白猿為其醫(yī)治發(fā)現(xiàn)肚了里的《九陽(yáng)真經(jīng)》，之后無(wú)忌就長(zhǎng)大了，這時(shí)再與白猿對(duì)話，然后再去另一邊再找白猿，點(diǎn)擊前面的石塊就會(huì)發(fā)現(xiàn)金織靴、象牙戒指、金錢(qián)500，之后再去找朱長(zhǎng)齡，但是無(wú)忌卻被朱長(zhǎng)齡設(shè)計(jì)摔斷了雙腿。

 畫(huà)面一轉(zhuǎn)，蛛兒來(lái)了，與她談完話后，何太沖一行人來(lái)找蛛兒尋仇，無(wú)忌暗中出手擊退眾人。就在蛛兒要帶無(wú)忌離開(kāi)村莊的時(shí)候卻遇到了滅絕師太，滅絕將二人帶到了大漠，在滅絕與明教的交手中，無(wú)忌挺身而出接下滅絕三掌，但是蛛兒卻被韋一笑擄走，無(wú)忌趕緊追了上去，這里有很長(zhǎng)的一段路程，途中會(huì)經(jīng)過(guò)六大派再加明教五行旗的地圖，在這里不能貪多，打一會(huì)兒就去昆侖山壁道存檔，最好去打少林派，因?yàn)殄X(qián)多，不像峨嵋派，窮得不像樣，話說(shuō)回來(lái)，少林一個(gè)個(gè)都是大款來(lái)著，不僅有200多的錢(qián)，并且有汲水長(zhǎng)衫，汲水鞋等現(xiàn)時(shí)不錯(cuò)的裝備，還有寒冰（510攻），穿云劍（510攻），青宏劍（570攻）等不錯(cuò)的武器，可以買(mǎi)個(gè)好價(jià)錢(qián)，為在中期大都城買(mǎi)裝備作準(zhǔn)備。

 走到大漠邊緣沒(méi)追到韋一笑卻在見(jiàn)到了布袋和尚說(shuō)不得，之后無(wú)忌被他裝入乾坤袋帶去了光明頂議事廳，明教眾人因?yàn)檠哉Z(yǔ)不和發(fā)生武功爭(zhēng)斗，所有人均被成昆偷襲，無(wú)忌出手擊傷成昆，并追著他進(jìn)入了明教?hào)|庭院，然后進(jìn)入楊不悔的房間見(jiàn)到了她和小昭，楊不悔趕去了議事大廳，而無(wú)忌與小昭繼續(xù)追成昆進(jìn)入了秘道，兩人中了成昆的陷阱。在尋找道路的時(shí)候無(wú)忌在練功室獲得了乾坤大挪移心法，練不練無(wú)所謂，用處不大，非常難練，并且威力和實(shí)際并不符合，上面寫(xiě)的是防加65-75，實(shí)際卻只有30，并且持續(xù)時(shí)間超短。之后進(jìn)入四個(gè)不同的房間內(nèi)才能走出去，光明頂密道32個(gè)房間對(duì)應(yīng)如下（順序由上而下）：
少陰主間 少陽(yáng)主間 太陰主間 太陽(yáng)主間
訟之間：5號(hào)門(mén) 無(wú)妄之間：2號(hào)門(mén) 旅之間：4號(hào)門(mén) 中孚之間：6號(hào)門(mén)
姤之間：4號(hào)門(mén) 同人之間：1號(hào)門(mén) 否之間：7號(hào)門(mén) 大有之間：9號(hào)門(mén)
困之間：4號(hào)門(mén) 屯之間：7號(hào)門(mén) 蹇之間：1號(hào)門(mén) 小畜之間：4號(hào)門(mén)
鼎之間：1號(hào)門(mén) 噬嗑之間：0號(hào)門(mén) 謙之間：8號(hào)門(mén) 泰之間：1號(hào)門(mén)
解之間：2號(hào)門(mén) 復(fù)之間：5號(hào)門(mén) 豫之間：5號(hào)門(mén) 覆之間：0號(hào)門(mén)
師之間：7號(hào)門(mén) 既濟(jì)之間：6號(hào)門(mén) 遯之間：6號(hào)門(mén) 夬之間：8號(hào)門(mén)
井之間：8號(hào)門(mén) 離之間：9號(hào)門(mén) 艮之間：9號(hào)門(mén) 干之間：9號(hào)門(mén)
坎之間：9號(hào)門(mén) 明夷之間：4號(hào)門(mén) 坤之間：0號(hào)門(mén) 歸妹之間：7號(hào)門(mén)

 需要說(shuō)明的是要把房間里的骷髏會(huì)部消滅了，門(mén)才能打開(kāi)，如果走錯(cuò)了，會(huì)在原房間不變，但不需要消失里面的骷髏可以直接開(kāi)門(mén)了，小心火骷髏，噴一下就費(fèi)你200+的血，有必要使用一陽(yáng)指干掉他們。在訟之間滅掉癲狂骷髏，小昭就會(huì)告訴無(wú)忌離開(kāi)的方法，按照小昭的提示最后會(huì)進(jìn)入大石室，無(wú)忌推開(kāi)石門(mén)即可離開(kāi)。趕到圣火壇發(fā)現(xiàn)六大派已經(jīng)開(kāi)始與明教開(kāi)戰(zhàn)，無(wú)忌出手與六大派高手一一對(duì)戰(zhàn)，勝利后在光明頂議事大廳無(wú)忌被推舉為新的教主。這時(shí)忽然得報(bào)有大量敵人來(lái)犯，因?yàn)槊鹘檀藭r(shí)元?dú)獯髠�，無(wú)忌令所有人全部退入密道內(nèi)。